从遗传角度讲，边牧分成两大品系，分别是草原系（又称苏格兰边牧）和荒漠系（又称美国边牧） 一般说来，我们所说的“边境牧羊犬”，就是指原产于苏格兰的边牧，它们具有明显的苏格兰高原特征----浓密的眉毛和睫毛、圆滚滚的脸蛋和眼睛、长长的耳朵和尾巴；而原产于美国的边牧，则拥有更修长的体型、更窄的脸庞以及直直的耳道和尾巴。
但这两大品系的边界并不是非黑即白，也有部分杂交的混血狗存在。 由于历史原因，现在能够购买的纯种边境牧羊犬大多源自美国品系，因为美国边牧在1950年代已经被引入到许多国家，并被作为宠物饲养。相比之下，苏格兰边的原种血统要更为纯正一些，但是美国边牧的身体素质要比其强壮很多。
不过，无论是英国边还是美国边，在聪明程度和服从性方面都没有什么差别。 近年来，通过人工方式培育出来的杂交狗也越来越多。有研究人员选取了全球60万条边境牧羊犬的数据进行统计分析，发现其中的74%属于两种或以上的品系交叉繁殖所育成的杂交狗。
虽然许多主人喜欢寻找拥有“纯正血统”的宠物犬，但对于边境牧羊犬来说，其实并没有真正意义上的“纯种”一说。
益玥彤优质答主边境牧羊犬在各个国家地区，甚至不同血系间确实存在体型大小的差异。但是犬只的体型大小差异并不构成犬只质量优劣的分水岭，更不应区分所谓大型或者中型。作为犬种群，边境牧羊犬的犬种标准有明确的阐述。
边境牧羊犬的犬种标准是由各国的犬业俱乐部所制定和认可的。各个国家或地区在犬种标准的字句上存有差异，但是精神是高度一致的。
FCI(Federation Cynologique Internationale，世界犬业联盟）边境牧羊犬的标准对成年犬的体高描述为51到56CM，雌犬可以再低2CM。AKC(American Kennel Club，美国犬业协会）边境牧羊犬标准对成年犬的体高描述为53到59CM，雌犬可以再低3CM。其他各国或地区的犬业俱乐部的标准和以上两个组织的标准相差不多，或者一致。
在犬种定义上，一般认为体高（犬只直立时，肩胛骨顶端到地面的高度）在55CM以上的是大型犬，在40CM以下的是小型犬，其余为中型犬。
按犬种标准的描述范围，边境牧羊犬属于大型犬。实际中从市场上购买的犬只，成年的体高可能会低过犬种标准的下限，这些犬只也可能是纯种边境牧羊犬。犬种群的犬只不一定能达到犬种标准规定的最佳体型。所以，犬只的犬种鉴定是允许的，犬只的展览也有可能获奖。
有一些边境牧羊犬，成年犬只体高较低，一般为38到45CM。这类犬只通常是由于基因缺陷造成，是应该被禁止近交和繁殖的犬只。
